Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms