Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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