Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms