Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms