Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms