Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms