Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms