Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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