Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms