Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms