Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms