Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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