Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF4Q9BSR8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms