Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms