Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C2orf48Q96LS8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C2orf48Q96LS8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C2orf48Q96LS8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C2orf48Q96LS8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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