Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms