Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms