Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms