Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC4Q8TBB5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms