Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms