Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms