Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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