Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZP5

DUSP27, Inactive dual specificity phosphatase 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP27Q5VZP5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP27Q5VZP5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms