Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FAM208BQ5VWN6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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FAM208BQ5VWN6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FAM208BQ5VWN6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FAM208BQ5VWN6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FAM208BQ5VWN6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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