Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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LRRC38Q5VT99 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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LRRC38Q5VT99 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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LRRC38Q5VT99 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRC38Q5VT99 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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