Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms