Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms