Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms