Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms