Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms