Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms