Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NDUFA9Q16795 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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