Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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