Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
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