Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAM2Q15035 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAM2Q15035 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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TRAM2Q15035 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TRAM2Q15035 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TRAM2Q15035 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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TRAM2Q15035 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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TRAM2Q15035 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAM2Q15035 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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