Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms