Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms