Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms