Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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TUBA3CQ13748 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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