Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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