Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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