Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR5A1Q13285 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms