Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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STX4Q12846 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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