Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms