Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms