Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX1T1Q06455 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms