Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms