Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms