Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms