Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms